Autres appellations ou acronymes

FR004100

Date (Publication)

2020-12-31T12:00:00

Identificateur

Zostera marina habitat suitability along French Coast in Bay of Biscay and Channel Sea

Identificateur

DOI:10.12770/f39a2450-6b86-4093-9e32-4023957cbcb4

Forme de la présentation

Carte numérique

Reconnaissance

Ifremer - Unité Dynamiques des Écosystèmes Côtiers

Etat

Finalisé

Contact pour la ressource

Nom de l'organisation	Nom de la personne	Adresse e-mail	Rôle
Ifremer	Romain Mouillard	Romain.Mouillard@ifremer.fr	Auteur
Ifremer	Martin Marzloff	Martin.Marzloff@ifremer.fr	Auteur
Ifremer	Mickaël Vasquez	Mickael.Vasquez@ifremer.fr	Auteur
Ifremer		sismer@ifremer.fr	Editeur (publication)

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

• Habitats et biotopes

Thème

• Zostera marina

• Marha

Discipline

• SDM

• HSM

• Carte modélisée de l'habitat potentiel

Localisation

• Golfe de Gascogne

• Manche

Cadre Réglementaire - SIMM

• Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM)

Sous-regions marines

• /Métropole/Golfe de Gascogne

• /Métropole/Manche mer du Nord

• /Métropole/Mers Celtiques

Thématiques - SIMM

• /Etat du Milieu/Habitats

• Recherche

Contraintes d'accès

Autres restrictions

Autres contraintes

no limitations to public access

Limitation d'utilisation

Product under creative common license CC BY-NC-SA: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/

Limitation d'utilisation

Citation in bibliography should be as follows: Romain Mouillard, Martin Marzloff, Mickaël Vasquez (2020). Zostera marina habitat suitability along French Coast in Bay of Biscay and Channel Sea. Ifremer. https://doi.org/10.12770/f39a2450-6b86-4093-9e32-4023957cbcb4

Type de représentation spatiale

Raster

Distance de résolution

0.004501612  degrees

Langue de la ressource

English

Encodage des caractères

Utf8

Catégorie ISO

• Océans
• Biologie, faune et flore

Date de début

2021-01-01T12:00:00Z

Date de fin

2021-01-01T12:00:00Z

Nom du système de référence

EPSG / 4326

Ressource en ligne

Protocole	Adresse Internet	Nom
WWW:LINK	https://archimer.ifremer.fr/doc/00667/77870/	Stage de fin d'étude: Mouillard Romain (2020). Modélisation statistique de la distribution spatiale des espèces Zostera marina et Zostera noltei à l'échelle de la façade Manche-Atlantique. Mémoire de fin d’études d’Ingénieur Agronome, spécialité « Sciences halieutiques et aquacoles » préparée à Agrocampus Ouest. Option « Ressources et Ecosystèmes Aquatiques ».
WWW:LINK-1.0-http--metadata-URL	https://doi.org/10.12770/f39a2450-6b86-4093-9e32-4023957cbcb4	DOI of the dataset

Ressource en ligne

Protocole	Adresse Internet	Nom
OGC:WMS	https://sextant.ifremer.fr/services/wms/biologie?	IFR_ZOSTERA_MARINA_HABITAT_SUITABILITY
COPYFILE		IFR_ZOSTERA_MARINA_HABITAT_SUITABILITY

Ressource en ligne

Protocole	Adresse Internet	Nom
OGC:WMS	https://sextant.ifremer.fr/services/wms/biologie?	IFR_ZOSTERA_MARINA_HABITAT_SUITABILITY_SD
COPYFILE		IFR_ZOSTERA_MARINA_HABITAT_SUITABILITY_SD

Ressource en ligne

Protocole	Adresse Internet	Nom
OGC:WMS	https://sextant.ifremer.fr/services/wms/biologie?	IFR_ZOSTERA_MARINA_BINARY_HABITAT_SUITABILITY
FILE		IFR_ZOSTERA_MARINA_BINARY_HABITAT_SUITABILITY

Niveau

Jeu de données

Généralités sur la provenance

La bathymétrie, le KdPar, la température, le fetch, la vitesse du courant et d'autres variables ont été utilisés comme prédicteurs. Des modèles Random forest ont été ajustés et évalués en utilisant N=393 présences de Zostera marina. 10 ensembles de N pseudo-absences ont été tirés au hasard pour consolider 10 jeux de données différents de présence/pseudo-absence. 79 occurrences (20 % de N) et 79 pseudo-absences ont été mises de côté pour une validation indépendante des résultats. Afin d'évaluer la sensibilité des résultats aux pseudo-absences, un modèle Random Forest a été ajusté pour chaque jeu de données présence/pseudo-absence (donc 10 modèles). Chaque modèle a été joué sur des rasters de prédicteurs afin de prédire l'habitat potentiel en tout point de l'espace le long des côtes françaises de l'Atlantique et de la Manche. Une approche de modélisation d'ensemble a été utilisée pour produire une seule estimation moyenne d'habitat potentiel en utilisant une moyenne pondérée entre les prédictions des 10 modèles, (pondération basée sur la qualité de l'ajustement telle qu'évaluée par le paramètre AUC - Area Under the receiver-operating Curve). L'écart type autour de l'indice moyen d'habitat potentiel correspond à l'écart type entre les 10 estimations du modèle. Les estimations de l'indice d'habitat potentiel ont été classées en prédictions binaires 0/1 en fonction de seuils spécifiques à chaque modèle, en utilisant le jeu de données de validation et le critère d'optimisation de seuil spécificité=sensibilité. Le mode dominant parmi les dix estimations binaires du modèle est présenté dans le raster de l'indice binaire d'habitat potentiel. Enfin, Zostera marina ne pouvant se fixer sur des fonds durs, des polygones de roche issus du produit "seabed substrate" d'EMODnet Geology ont été utilisés pour post-traiter les produits raster comme suit : dans les pixels où la roche est présente, les deux indices d'habitat potentiel ont été fixés à 0, et l'écart-type à NA.

Données de présence : Les données d’observation provenaient d'études locales diverses réalisées par différents organismes (Ifremer, Office Français de la Biodiversité, Parcs naturels marin, universités etc.) dans le cadre de divers suivis écologiques (Réseau Natura 2000, OSPAR, CARTHAM, réseau REBENT etc.). L’ensemble des relevés, à la fois surfaciques et ponctuels, couvraient une période allant de 2000 à 2016, et reposaient sur des méthodes de prospection variées (par exemples : photos aériennes, plongées etc.).

Variables environmentales : les covariables suivantes ont été utilisées pour ajuster les modèles Random Forest.

-profondeur : MNT résolution spatiale 100m source EMODnet Bathymétrie

-KdPAR (coefficient d'atténuation diffuse du rayonnement photosynthétique, indicateur de la transparence de l'eau) : source EMODnet Seabed Habitat, résolution spatiale 250m, valeurs moyennes (couverture temporelle 5 ans -2005-2009, résolution temporelle 1 jour)

-PAR (rayonnement photosynthétique actif) : source EMODnet Seabed Habitat, résolution spatiale 4000m, valeurs moyennes (couverture temporelle 5 ans -2005-2009, résolution temporelle 1 jour)

-Fetch: source Burrows Wave fetch GIS layers for Europe, résolution spatiale 100m ( https://doi.org/10.6084/m9.figshare.8668127)

-Chlorophylle-a, phosphate, nitrate, oxygène dissous : source archive MARC de l'Ifremer, résolution spatiale 4000m, valeurs moyennes (couverture temporelle 7 ans -2012-2018, résolution temporelle 1 jour)

-Température de l'air : archives Arome - Météo France, résolution spatiale 1000m, valeurs moyennes (couverture temporelle 7 ans -2012-2018, résolution temporelle 1 heure)

-Vitesse du courant de marée, température de l'eau, salinité : source archives MARC de l'Ifremer, résolution spatiale 500m, valeurs moyennes (couverture temporelle 6 ans, 2010-2015, résolution temporelle 1 heure)

-Énergie des vagues : source archives Ifremer Homère, résolution spatiale 300m, valeurs du percentile 90 (couverture temporelle 6 ans, 2010-2015, résolution temporelle 1 heure)

Métadonnées

Identifiant de la fiche

f39a2450-6b86-4093-9e32-4023957cbcb4 XML

Langue

English

Jeu de caractères

Utf8

Type de ressource

Jeu de données

Date des métadonnées

2024-01-24T16:16:19.597Z

Nom du standard de métadonnées

ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

Version du standard de métadonnées

1.0

Contact

Nom de l'organisation	Nom de la personne	Adresse e-mail	Rôle
Ifremer	Mickaël Vasquez	Mickael.Vasquez@ifremer.fr	Point de contact

Autre langue

LanguageCode	CharacterEncoding
Français	Utf8
Anglais	Utf8