Deep-sea habitat mapping in the Bay of Biscay.

The deep-sea habitats in the Bay of Biscay were mapped by Ifremer's deep-sea laboratory as part of the CoralFish project and an agreement between Ifremer and the French Marine Protected Areas Agency.

The method used for this habitat mapping is based on the preliminary analysis of videos and images acquired with the ROV Victor 6000 and the SCAMPI towed camera during several oceanographic campaigns: BOBGEO1 (from 14/10/2009 to 28/10/2009, mission chiefs: Jean-François BOURILLET), EVHOE 2009 (from 18/10/2009 to 01/12/2009, mission chiefs: Jean-Pierre LEAUTE and Michèle SALAUN), BOBGEO2 (from 18/07/2010 to 25/07/2010, mission chief: Jean-François BOURILLET, Ifremer Brest), EVHOE 2010 (from 18/10/2010 to 02/12/2010, mission leaders: Jean-Pierre LEAUTE and Michèle SALAUN), BOBECO (from 9/09/2011 to 11/10/2011, mission chiefs: Sophie ARNAUD-HAOND and Anthony GREHAN) and EVHOE 2012 (from 18/10/2012 to 02/12/2012, mission chiefs: Jean-Pierre LEAUTE and Michèle SALAUN).

The observed habitats were defined according to the CoralFish typology (Davies et al. 2017) and delimited according to the observations made on the images and video profiles. For the purpose of this mapping, it was decided to retain only habitats with a minimum area of 25m², i.e. segments of at least 5 metres in length, defined by at least 2 identical contiguous observations. Then, to the habitats of level 3 of the CoralFish classification, were associated the habitats of the national typology (HABREF, Michez et al. 2019) and the habitats of international typology, in particular the Vulnerable Marine Ecosystems (VME, ICES 2020), the reef habitat '1170' as defined by the European Habitat Fauna Flora Directive, and the OSPAR list of threatened and/or declining species and habitats.

The fields of the attritube table are as follows:

Seg_code: Unique code assigned to a habitat segment along each dive profile, the code consists of the cruise code, the dive number in the cruise and a unique number per segment

Cruise: Name of the oceanographic cruise

Dive: Diving number in the cruise

Dive_code: Unique cruise/dive code

Canyon: Canyon in which the transect is located

Date: Dive date

Time: start time of observation of a habitat segment

Latitude: Latitude of the start of the habitat segment

Longitude: Longitude of the start of the habitat segment

Hab_niv1: Level 1 habitat of the CoralFish typology (Davies et al. 2017)

Hab_niv2: Level 2 habitat of the CoralFish typology (Davies et al. 2017)

Hab_niv3: Level 3 habitat of the CoralFish typology (Davies et al. 2017)

VME: Indicates whether the transect is associated with a vulnerable (VME) or non-vulnerable (Non-VME) marine ecosystem

CD_HAB: Code associated with the NatHab-Atl habitat typology/Unique identifier of the habitat.

LB_CODE: Code associated with the wording of the NatHab-Atl typology/Habitat unit code; Level 1 is identified by a letter: M for soft substrate habitats, R for rocky substrate habitats and P for specific habitats. Levels 2 to 7 are identified by numbers separated by dots.

TypoAtlMMN: Label associated with the NatHab-Atl habitat typology

VMEHABTYPE: Label associated with a VME habitat type according to ICES typology

VMESUBTYPE: Label associated with a VME habitat subtype according to ICES typology

OSPAR_List: Label associated with the OSPAR habitat typology

CDHABOSPAR: Code associated with the OSPAR habitat typology

Natura2000: Code associated with the list of habitats of community interest (1170 = Reefs)

Length: Length of the habitat segment in meters

CruiseName: Name of the oceanographic cruise

Cruiseship: Name of the ship used for the oceanographic cruise

C_Vehicle: Name of the robot / instrument responsible for acquiring photos/videos during the oceanographic cruise

C_StartDat: Start date of the oceanographic cruise

C_EndDat: End date of the oceanographic cruise

C_Location: Location of the oceanographic cruise = Bay of Biscay

References :

Davies, J.S., Guillaumont, B., Tempera, F., Vertino, A., Beuck, L., Ólafsdóttir, S.H., Smith, C.J., Fosså, J.H., van den Beld, I.M.J., Savini, A., Rengstorf, A., Bayle, C., Bourillet, J.F., Arnaud-Haond, S., Grehan, A., 2017. A new classification scheme of European cold-water coral habitats: Implications for ecosystem-based management of the deep sea. Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography 145: 102-109, 10.1016/j.dsr2.2017.04.014.

Michez, N., Thiébaut, E., Dubois, S., Le Gall, L., Dauvin, J.-C., Andersen, A.C., Baffreau, A., Bajjouk, T., Blanchet, H., de Bettinies, T., De Casamajor, M.-N., Derrien-Courtel, S., Houbin, C., Janson, A.-L., La Rivière, M., Lévèque, L., Menot, L., Sauriau, P.-G., Simon, N., Viard, F., 2019. Typologie des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. VERSION 3.

ICES, 2020. ICES/NAFO Joint Working Group on Deep-water Ecology (WGDEC). ICES Scientific Reports 2 (62), 171, 10.17895/ices.pub.7503.

Date (Publication): 2020-12-17T10:00:00

Citation identifier: DOI:10.12770/f1c5ec41-046e-4ba0-83d3-114dd2e9450a

Citation identifier: https://sextant.ifremer.fr/geonetwork/f1c5ec41-046e-4ba0-83d3-114dd2e9450a

Credit: IFREMER, BOBGEO1 & 2, EVHOE 2009, 2010, 2012, BOBECO

Financement : Ce projet a été financé par le programme de fond européen pour la recherche et l'innovation FP7 sous l'agrément n°213144 (CoralFISH) et par le programme européen pour la recherche et l'innovation Horizon 2020 sous l'agrément n°678760 (ATLAS). L'Agence des Aires Marines Protégées (désormais Agence Française pour la Biodiversité) a apporté un soutien financier pour l'annotation des images. La thèse d'Inge van den Beld a été co-financée par la région Bretagne et l'Ifremer.

Point of contact

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
IFREMER	Van Den Beld Inge		Author
IFREMER	Menot Lenaick	Lenaick.Menot@ifremer.fr	Author
IFREMER	Tourolle Julie	julie.tourolle@ifremer.fr	Author
Ifremer		julie.tourolle@ifremer.fr	Publisher

Thèmes Sextant

/Biological Environment/Habitats

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

Habitats and biotopes

Keywords

Coraux d'eau froide
Habitats marins vulnérables
Récifs
EMV

Thématiques - SIMM

/Environmental Status/Habitats
Research

Sous-regions marines

/Metropolitan France/Bay of Biscay

Cadre Réglementaire - SIMM

Marine Strategy Framework Directive (MSFD)

DCSMM : Descripteurs

D1: Coastal benthic habitats

Access constraints: Other restrictions

Use constraints: Copyright

Other constraints: Obligation de citation dans la bibliographie : "Van den Beld I., Tourolle J., Menot L., 2020. Cartographie des habitats marins profonds du golfe de Gascogne. https://doi.org/10.12770/f1c5ec41-046e-4ba0-83d3-114dd2e9450a ."

Spatial representation type: Vector

Denominator: 500000

Language: Français

Character set: UTF8

Topic category

Oceans
Environment

Begin date: 2009-04-10T08:00:00

End date: 2012-11-30T20:00:00

Reference system identifier: EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 7.4

Geometric object type: Curve

Distribution format

Name	Version

OnLine resource

Protocol	Linkage	Name
WWW:LINK-1.0-http--publication-URL	https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmars.2017.00118/full	van den Beld, I.M.J., Bourillet, J.-F., Arnaud-Haond, S., de Chambure, L., Davies, J.S., Guillaumont, B., Olu, K., Menot, L., 2017. Cold-Water Coral Habitats in Submarine Canyons of the Bay of Biscay. Frontiers in Marine Science 4 (118).
WWW:LINK	https://doi.org/10.1016/j.dsr2.2017.04.014	Typologie CoralFish
WWW:LINK	https://www.seanoe.org/data/00422/53313/	SEANOE
FILE		BoB_Habitats_sextant
OGC:WMS	https://sextant.ifremer.fr/services/wms/biologie	IFR_EEP_BOB_HABITATS
WWW:LINK	http://dx.doi.org/10.12770/f1c5ec41-046e-4ba0-83d3-114dd2e9450a	DOI du jeu de données

Hierarchy level: Dataset

Conformance result

Date (Publication): 2010-12-08

Explanation: See the referenced specification

Statement: La cartographie a été réalisée en 2013 dans le cadre du projet CoralFish et d'une convention entre l'Ifremer et l'Agence des Aires Marines Protégées. L'approche retenue pour la réalisation de cette cartographie s'appuie sur le traitement et l'interprétation des vidéos et des images acquises à l'aide du ROV Victor 6000 et de la caméra tractée SCAMPI lors de campagnes océanographiques réalisées entre 2009 et 2012 dans le golfe de Gascogne. La cartographie a été mise à jour en 2020.

Description: 1/ SUPPORTS : les vidéos et images utilisées pour réaliser cette cartographie proviennent des campagnes océanographiques suivantes : BOBGEO1, EVHOE 2009, BOBGEO2, EVHOE 2010, BOBECO et EVHOE 2012.

Description: 2/ CAMPAGNES EN MER :

- la campagne BOBGEO1 s'est déroulée du 14/10/2009 au 28/10/2009, à bord du Pourquoi Pas ? ; le chef de mission était Jean-François BOURILLET (Géosciences Marines, Ifremer Brest) - https://doi.org/10.17600/9030060 ,

- la campagne EVHOE 2009 s'est déroulée du 18/10/2009 au 01/12/2009, à bord de la Thalassa ; les chefs de mission étaient Jean-Pierre LEAUTE, Michèle SALAUN et Joël DIMEET (Ifremer, Station de La Rochelle-L'Houmeau) - https://doi.org/10.17600/9040060,

- la campagne BOBGEO2 s'est déroulée du 18/07/2010 au 25/07/2010, à bord du Suroît ; le chef de mission était Jean-François BOURILLET (Géosciences Marines, Ifremer Brest) - https://doi.org/10.17600/10020020 ,

- la campagne EVHOE 2010 s'est déroulée du 18/10/2010 au 02/12/2010, à bord de la Thalassa ; les chefs de mission étaient Jean-Pierre LEAUTE, Michèle SALAUN et Robert BELLAIL (Ifremer, Station de La Rochelle-L'Houmeau) - https://doi.org/10.17600/10040080,

- la campagne BOBECO s'est déroulée du 9/09/2011 au 11/10/2011 à bord du Pourquoi Pas ? ; les chefs de mission étaient Sophie Arnaud-Haond (Ifremer, Station de Sète) et Anthony Grehan (Université de Galway, Irlande) - https://doi.org/10.17600/11030090 et https://doi.org/10.17600/11030180 ,

- la campagne EVHOE 2012 s'est déroulée à bord de la Thalassa ; les chefs de mission étaient Jean-Pierre LEAUTE, Michèle SALAUN et Lionel PAWLOWSKI (Ifremer, Station de La Rochelle-L'Houmeau) - https://doi.org/10.17600/12040080 .

Description: 3/ TRAITEMENT DES VIDÉOS ET DES IMAGES : Les vidéos et les images sont géoréférencées et ont été annotées par Inge Van den Beld, Brigitte Guillaumont et Jamie Davies sous les logiciels Adelie ou Cover. Les habitats de coraux d'eau froide observés ont été décrits suivant le niveau 1 de la classification publiée par Davies et al., 2017 (J.S. Davies, B. Guillaumont, F. Tempera, A. Vertino, L. Beuck, S.H. Ólafsdóttir, C.J. Smith, J.H. Fosså, I.M.J. van den Beld, A. Savini, A. Rengstorf, C. Bayle, J.-F. Bourillet, S. Arnaud-Haond, A. Grehan, A new classification scheme of European cold-water coral habitats: Implications for ecosystem-based management of the deep sea, In Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography, Volume 145, 2017, Pages 102-109, ISSN 0967-0645, https://doi.org/10.1016/j.dsr2.2017.04.014 ).

Description: 4/ TRAITEMENT DES DONNÉES : Les observations faites à partir des vidéos et des images ont été exportées sous ArcGis puis mises en relation avec la navigation de chaque plongée ROV. Il en résulte une cartographie des habitats sous forme de polylignes qui correspondent à la navigation de la caméra, et qui sont segmentées selon les habitats observés.

Description: 5/ VALORISATION : Ces travaux ont fait l'objet d'une thèse de doctorat (Van Den Beld Inge, 2017. Habitats coralliens dans les canyons sous-marins du Golfe de Gascogne : distribution, écologie et vulnérabilité / Coral habitats in submarine canyons of the Bay of Biscay : distribution, ecology and vulnerability . PhD Thesis , Université de Bretagne occidentale). Une publication a également été acceptée : Van Den Beld Inge, Bourillet Jean-Francois, Arnaud-Haond Sophie, De Chambure Laurent, Davies Jaime S, Guillaumont Brigitte, Olu Karine, Menot Lenaick (2017). Cold-water coral habitats in submarine canyons of the Bay of Biscay . Frontiers in Marine Science , 4(118), 1-30 . Publisher's official version : http://doi.org/10.3389/fmars.2017.00118 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00382/49343/ .

Metadata

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Metadata language: Français

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Date stamp: 2024-01-24T14:10:04.791Z

Metadata standard name: ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

Metadata standard version: 1.0

Metadata author

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
IFREMER	Tourolle Julie	Julie.Tourolle@ifremer.fr	Point of contact
IFREMER	Menot Lenaick	Lenaick.Menot@ifremer.fr	Point of contact

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