Date (Creation)

2018

Citation identifier

DCSMM2018_CNRS_HP_D1C6_CHLOROPHYLLE_A_RATIO

Citation identifier

DOI:10.12770/921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd

Credit

CNRS

Point of contact

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
CNRS	Marie Duflos	marie.duflos@log.cnrs.fr	Author
CNRS	Guillaume Wacquet		Author
CNRS	Anaïs Aubert		Author
CNRS	Isabelle Rombouts		Author
CNRS	Benoit Mialet		Author
Ifremer	David Devreker	David.Devreker@ifremer.fr	Author
Ifremer	Alain Lefebvre	Alain.Lefebvre@ifremer.fr	Author
CNRS	Luis Felipe Artigas	felipe.artigas@univ-littoral.fr	Author
Ifremer		sismer@ifremer.fr	Publisher

Thèmes Sextant

• /Milieu chimique/Colonne d'eau

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

• Répartition des espèces

Theme

• évaluation

• bon état écologique

• chlorophylle

• habitat pélagique

• Données ouvertes

DCSMM : Descripteurs

• D1: Biodiversité - Habitats pélagiques

Sous-regions marines

• /Métropole/Golfe de Gascogne

• /Métropole/Manche mer du Nord

Cadre Réglementaire - SIMM

• Directive Cadre pour la Planification de l'Espace Maritime (DCPEM)

• Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM)

Thématiques - SIMM

• /Etat du Milieu/Biogéochimie

Keywords

• DCSMM

• hvd

High-value dataset categories

• Observation de la terre et environnement

Use limitation

Données sous Licence Creative Commons - Attribution (BY) : http://creativecommons.fr/licences/

Access constraints

License

Use constraints

Copyright

Spatial representation type

Vector

Denominator

100000

Language

Français

Character set

UTF8

Topic category

• Biota

Begin date

2012

End date

2016

Reference system identifier

EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6

Geometric object type

Surface

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Hierarchy level

Dataset

Statement

Les indicateurs pour l’évaluation du bon état écologique des habitats pélagiques, ont été développés dans le cadre de la convention OSPAR par le groupe de travail « Intersessional Correspondence Group - Coordination of Biodiversity Assessment and Monitoring » (ICG-COBAM.

L’indicateur PH1 est basé sur la méthode du Plankton Index (PI, Gowen et al., 2013 ; Tett et al., 2013). En raison du manque de données complètes par paire de groupes fonctionnels et de la difficulté d’accessibilité de son script, le PH1 n’a pu être évalué pour l’évaluation 2018. En complément, une approche parallèle au PH1 (ratios à partir de données pigmentaires extraites à partir de la modélisation) a pu être proposée, pour une des paires de groupes fonctionnels, de façon à couvrir les différentes SRM. Cette approche n’est pas destinée à être généralisée à l’avenir, ni à remplacer le PH1. Elle est présentée à titre d’exemple, afin d’illustrer le potentiel de ce type de données pour renseigner un des couples fonctionnels (dinoflagellés/diatomées) qui permettront de calculer le PH1.

Le calcul de ce rapport dinoflagellés/diatomées s’est fait via la concentration en chlorophylle a. à partir des données issues de la modélisation par le modèle ECO-MARS3D ; par trimestre pour rendre compte de la phénologie des groupes d'espèces considérés. La métrique choisie est le percentile 90 de la concentration en chlorophylle a de chacun de ces groupes. Ce processus s’est fait au moyen de scripts informatiques écrits en langage R ( https://cran.r-project.org/ ), il se passe en plusieurs étapes (Figure 4) :

1-Traitement des données de campagnes mesurées in situ pour obtenir des matrices géoréférencées.

2-Compilation de toutes les matrices (sous forme de raster NetCDF) comprises dans chaque trimestre pour la période d'évaluation (2012-2016).

3-Extraction des données (dinoflagellés et diatomées) de surface contenues dans chacune des UGE.

4-Calcul du percentile 90 par trimestre dans chacune de ces UGE pour synthétiser l’information à une échelle plus propice à l’interprétation et compatible avec le calcul des indicateurs.

5-Calcul du rapport dinoflagellés / diatomées par UGE

Source

• Données du réseau de surveillance du REPHY (2006 à 2016)

Metadata

File identifier

921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd XML

Metadata language

Français

Character set

UTF8

Hierarchy level

Dataset

Date stamp

2020-04-23T16:59:13

Metadata standard name

ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

Metadata standard version

1.0

Metadata author

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Ifremer		sextant@ifremer.fr	Point of contact