63e6c177-455e-5805-b70b-0894ee1c7174 INRAE Info&Sols INRAE Info&Sols 02 38 41 48 27 2163 avenue de la pomme de pin 2163 avenue de la pomme de pin Orléans 45075 France France infosol@inrae.fr infosol@inrae.fr 2024-02-06T15:21:23 ISO 19115:2003/19139 1.0 2295 EPSG:2154 EPSG:2154 http://www.opengis.net/def Vibrisses : seuils de détection d'anomalies pour différents éléments traces (RMQS) Vibrisses : seuils de détection d'anomalies pour différents éléments traces (RMQS) Vibrisses: anomaly detection thresholds for different trace elements (RMQS) 2018-01-06 2018-01-06 2023-02-13 https://agroenvgeo.data.inra.fr/geonetwork/srv/fre/catalog.search#/metadata/63e6c177-455e-5805-b70b-0894ee1c7174 Ce jeu de données rassemble les résultats du calcul d'indicateurs pouvant servir de seuils de détection d’anomalies en éléments traces (arsenic, cadmium, cobalt, chrome, cuivre, mercure, nickel, plomb, thallium, zinc) dans les sols de surface. Ces indicateurs correspondent à des vibrisses* calculées à partir d’un ensemble de mesures situées dans un rayon de 50 km autour du point considéré. Les mesures correspondent à des teneurs totales en éléments traces et proviennent des sites du Réseau de Mesures pour les horizons 0-30 cm (tous les éléments) et 30-50 cm (sauf pour l’arsenic et le Mercure). On considère ici que ces calculs régionalisés des vibrisses jouent un rôle d'indicateur de tendance régionale prenant en compte à la fois les valeurs de fonds pédo-géochimiques et les apports d'origine anthropique. Elles correspondent à la teneur limite au-delà de laquelle une valeur peut être considérée comme anomalique. Elles permettent ainsi de détecter les anomalies ponctuelles tout en s'affranchissant de la valeur de fond locale. *La vibrisse (supérieure) d'un ensemble de valeurs d'une variable statistique est égale au 3ème quartile augmenté de 1,5 fois l'écart entre les 1ers et 3èmes quartiles. Ce jeu de données rassemble les résultats du calcul d'indicateurs pouvant servir de seuils de détection d’anomalies en éléments traces (arsenic, cadmium, cobalt, chrome, cuivre, mercure, nickel, plomb, thallium, zinc) dans les sols de surface. Ces indicateurs correspondent à des vibrisses* calculées à partir d’un ensemble de mesures situées dans un rayon de 50 km autour du point considéré. Les mesures correspondent à des teneurs totales en éléments traces et proviennent des sites du Réseau de Mesures pour les horizons 0-30 cm (tous les éléments) et 30-50 cm (sauf pour l’arsenic et le Mercure). On considère ici que ces calculs régionalisés des vibrisses jouent un rôle d'indicateur de tendance régionale prenant en compte à la fois les valeurs de fonds pédo-géochimiques et les apports d'origine anthropique. Elles correspondent à la teneur limite au-delà de laquelle une valeur peut être considérée comme anomalique. Elles permettent ainsi de détecter les anomalies ponctuelles tout en s'affranchissant de la valeur de fond locale. *La vibrisse (supérieure) d'un ensemble de valeurs d'une variable statistique est égale au 3ème quartile augmenté de 1,5 fois l'écart entre les 1ers et 3èmes quartiles. This dataset gathers the results of the calculation of indicators that can serve as detection thresholds for trace element anomalies (arsenic, cadmium, cobalt, chromium, copper, mercury, nickel, lead, thallium, zinc) in surface soils . These indicators correspond to vibrisses calculated from a set of measurements located within a radius of 50 km around the considered point. The measurements correspond to total contents of trace elements and come from the sites of the Network of Measurements for horizons 0-30 cm (all elements) and 30-50 cm (except for arsenic and Mercury). We consider here that these regionalized calculations of the vibrisses play a role of indicator of regional tendency taking into account both the values ​​of pedo-geochemical bottoms and the contributions of anthropic origin. They correspond to the limit content beyond which a value can be considered as anomalous. They thus make it possible to detect punctual anomalies while avoiding the local background value. Saby, Nicolas; Villanneau, E; Toutain, B; Arrouays, D., 2018, "Seuils de détection d’anomalies pour 8 éléments traces métalliques (RMQS)", https://doi.org/10.15454/UEZXBY, Portail Data Inra, V1 Saby, Nicolas; Villanneau, E; Toutain, B; Arrouays, D., 2018, "Seuils de détection d’anomalies pour 8 éléments traces métalliques (RMQS)", https://doi.org/10.15454/UEZXBY, Portail Data Inra, V1 INRAE Info&Sols INRAE Info&Sols 2163 avenue de la pomme de pin 2163 avenue de la pomme de pin Orléans 45075 France France infosol@inrae.fr infosol@inrae.fr https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/ows?EXCEPTIONS=xml&TRANSPARENT=true&service=WMS&VERSION=1.3.0&SLD_VERSION=1.1.0&REQUEST=GetMap&LAYERS=vibrisses_ni_30_50&STYLES=&BBOX=98447.4715681,6033153.63511981,1244345.29288108,7125147.96578921&WIDTH=532&HEIGHT=532&CRS=EPSG:2154&FORMAT=image%2Fpng Aperçu de la couche vibrisses_ni_30_50 Aperçu de la couche vibrisses_ni_30_50 PNG postgis postgis RMQS RMQS Contamination Contamination data processing data processing vibrisses vibrisses France France éléments traces éléments traces statistiques statistiques ETM ETM Les valeurs fournies sur les seuils de détection d’anomalie doivent être manipulée avec précaution. Les interprétations qui en sont faites doivent ainsi tenir compte du caractère assez frustres de ces indicateurs. En effet, il est important de noter que les calculs ne prennent pas en compte les processus pédologiques locaux. Les valeurs fournies sur les seuils de détection d’anomalie doivent être manipulée avec précaution. Les interprétations qui en sont faites doivent ainsi tenir compte du caractère assez frustres de ces indicateurs. En effet, il est important de noter que les calculs ne prennent pas en compte les processus pédologiques locaux. The values provided on the anomaly detection thresholds must be handled with care. The interpretations that are made must take into account the rather frustrating nature of these indicators. Indeed, it is important to note that the calculations do not take into account local soil processes. Données soumises à une licence ouverte CC0 – « Public Domain Dedication ». : https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ Données soumises à une licence ouverte CC0 – « Public Domain Dedication ». : https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ Data subject to open license CC0 – « Public Domain Dedication ». : https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ Utilisation libre sous réserve de mentionner la source (à minima le nom du producteur) et la date de sa dernière mise à jour. Utilisation libre sous réserve de mentionner la source (à minima le nom du producteur) et la date de sa dernière mise à jour. Free use, subject to mentioning the source (at least the name of the producer) and the date of its last update. Pas de restriction d'accès public Pas de restriction d'accès public No restriction of public access 16000 geoscientificInformation environment France France -5.1602266165821 9.66797329732989 41.21249055567 51.2200910033619 postgis postgis INRAE Info&Sols INRAE Info&Sols 02 38 41 48 27 2163 avenue de la pomme de pin 2163 avenue de la pomme de pin Orléans 45075 France France infosol@inrae.fr infosol@inrae.fr https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wfs?service=WFS&version=2.0.0&request=GetFeature&typeName=gissol_rmqs:vibrisses_rmqs&outputFormat=shape-zip WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download vibrisses_rmqs vibrisses_rmqs Format Shapefile Format Shapefile https://doi.org/10.15454/UEZXBY WWW:LINK-1.0-http--link Dataverse Dataverse Données disponibles sur le GisSol Dataverse (INRA - Institut National de la Recherche Agronomique) Données disponibles sur le GisSol Dataverse (INRA - Institut National de la Recherche Agronomique) http://www.afes.fr/wp-content/uploads/2017/10/EGS_15_3_villanneau.pdf WWW:LINK-1.0-http--link E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200 E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200 Source bibliographique de la ressource Source bibliographique de la ressource https://www.gissol.fr/le-gis/programmes/rmqs-34 WWW:LINK-1.0-http--link Programme RMQS Programme RMQS Présentation du programme RMQS (Réseau de Mesures de la Qualité des Sols) Présentation du programme RMQS (Réseau de Mesures de la Qualité des Sols) https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_as_0_30 vibrisses_as_0_30 Visualiser la carte de l'Arsenic à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte de l'Arsenic à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_cd_0_30 vibrisses_cd_0_30 Visualiser la carte du Cadmium à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Cadmium à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_cd_30_50 vibrisses_cd_30_50 Visualiser la carte du Cadmium à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Cadmium à la profondeur 30-50 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_co_0_30 vibrisses_co_0_30 Visualiser la carte du Cobalt à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Cobalt à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_co_30_50 vibrisses_co_30_50 Visualiser la carte du Cobalt à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Cobalt à la profondeur 30-50 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_cr_0_30 vibrisses_cr_0_30 Visualiser la carte du Chrome à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Chrome à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_cr_30_50 vibrisses_cr_30_50 Visualiser la carte du Chrome à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Chrome à la profondeur 30-50 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_cu_0_30 vibrisses_cu_0_30 Visualiser la carte du Cuivre à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Cuivre à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_cu_30_50 vibrisses_cu_30_50 Visualiser la carte du Cuivre à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Cuivre à la profondeur 30-50 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_hg_0_30 vibrisses_hg_0_30 Visualiser la carte du Mercure à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Mercure à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_ni_0_30 vibrisses_ni_0_30 Visualiser la carte du Nickel à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Nickel à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_ni_30_50 vibrisses_ni_30_50 Visualiser la carte du Nickel à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Nickel à la profondeur 30-50 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_pb_0_30 vibrisses_pb_0_30 Visualiser la carte du Plomb à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Plomb à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_pb_30_50 vibrisses_pb_30_50 Visualiser la carte du Plomb à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Plomb à la profondeur 30-50 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_tl_0_30 vibrisses_tl_0_30 Visualiser la carte du Thalium à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Thalium à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_tl_30_50 vibrisses_tl_30_50 Visualiser la carte du Thalium à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Thalium à la profondeur 30-50 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_zn_0_30 vibrisses_zn_0_30 Visualiser la carte du Zinc à la profondeur 0-30 cm Visualiser la carte du Zinc à la profondeur 0-30 cm https://agroenvgeo.data.inra.fr/geoserver/gissol_rmqs/wms OGC:WMS vibrisses_zn_30_50 vibrisses_zn_30_50 Visualiser la carte du Zinc à la profondeur 30-50 cm Visualiser la carte du Zinc à la profondeur 30-50 cm La plupart des étapes des calculs des vibrisses sont réalisées à l’aide de scripts exécutés dans le logiciel R (R Development Core Team, 2007). La première étape est de calculer la distance entre les sites. Puis, une étape d’extraction, depuis la base de données, des concentrations en éléments traces pour chaque site est effectuée. Les étapes suivantes sont réalisées par élément trace et par couche à l’aide d’un seul script R : • Sélection, pour chaque site, des concentrations en éléments traces des sites voisins situés à une distance inférieure à 50 km, • Décompte du nombre de concentrations en éléments traces sélectionnées par site et non-calcul de vibrisse lorsque ce décompte est inférieur à 10, • Calcul, pour chaque site, de la vibrisse avec la formule suivante : v = médian + 3x l’écart interquartile. Source : E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200 La plupart des étapes des calculs des vibrisses sont réalisées à l’aide de scripts exécutés dans le logiciel R (R Development Core Team, 2007). La première étape est de calculer la distance entre les sites. Puis, une étape d’extraction, depuis la base de données, des concentrations en éléments traces pour chaque site est effectuée. Les étapes suivantes sont réalisées par élément trace et par couche à l’aide d’un seul script R : • Sélection, pour chaque site, des concentrations en éléments traces des sites voisins situés à une distance inférieure à 50 km, • Décompte du nombre de concentrations en éléments traces sélectionnées par site et non-calcul de vibrisse lorsque ce décompte est inférieur à 10, • Calcul, pour chaque site, de la vibrisse avec la formule suivante : v = médian + 3x l’écart interquartile. Source : E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200 Most of the steps for the calculation of the vibrisses are realized using scripts executed in the R software (R Development Core Team, 2007). The first step consists in calculating the distance between sites. Then, the trace elements concentrations are extracted from the database. The following steps are realized for each trace element and each layer with only one R script: • Selection, for each site, of the trace elements concentrations from the neighbouring sites within a distance of 50 km, • Count the number of sites with a trace element concentration, the vibrisse calculation is done only of there are at least 10 sites, • Calculation, for each site, of the vibrisse with the following formula: v = median + 3x interquartile range. Source: E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200 Cette fiche a été créée automatiquement par le programme 2ids Cette fiche a été créée automatiquement par le programme 2ids This metadata sheet was automatically created by the 2ids program