Date (Création)

1992-01-01T00:00:00

Identificateur

FR-DCSMM-PDS-REPAMO 2

Forme de la présentation

Profil numérique

But

Détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevages, mais aussi détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes exotiques affectant les mollusques marins sauvages et d’élevages.

Reconnaissance

Producteurs de données : conchyliculteurs, DDTM, Ifremer, réseau de laboratoires d'analyses agréés pour la recherche des maladies des mollulsques marins

Etat

Mise à jour continue

Contact pour la ressource

Nom de l'organisation	Nom de la personne	Adresse e-mail	Rôle
Ifremer, Laboratoire de Génétique et Pathologie des Mollusques Marins	Lydie Canier	Lydie.Canier@ifremer.fr	Point de contact
DGAL, Bureau de la santé animale		bsa.bdspa@agriculture.gouv.fr	Gestionnaire

Fréquence de mise à jour

Inconnue

Remarque sur la mise à jour

Durée du réseau : réseau temporaire

Mots clés

• Réseau

• Surveillance

• Mollusques

• Pathologie

• Réglementation

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

• Installations de suivi environnemental

DCSMM : Type d'espace concerné

• Pas d'espace particulier concerné

DCSMM : Descripteurs

• D9: Questions sanitaires

DCSMM : Méthodes de recueil des données

• Observation par point

Thèmes Sextant

• /Activités humaines/Réseaux d'observation et de surveillance du littoral

Centre de données ODATIS

• CDS-IS-SISMER

Type de jeux de donnée ODATIS

• Données d'observation

Thèmatiques ODATIS

• Dispositifs de surveillance

Sous-regions marines

• /Métropole

• /Métropole/Manche mer du Nord

• /Métropole/Méditerranée occidentale

• /Métropole/Mers Celtiques

• /Métropole/Golfe de Gascogne

Thématiques - SIMM

• /Activités et Usages/Pêche et Aquaculture

• Recherche

• /Etat du Milieu/Pollutions

• /Etat du Milieu/Littoral

ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names

• Invertébrés

• Organismes pathogènes

Contraintes d'accès

Autres restrictions

Autres contraintes

Libre

Limitation d'utilisation

Gratuit

Type de représentation spatiale

Raster

Dénominateur de l'échelle

6000000

Langue de la ressource

Français

Encodage des caractères

Utf8

Catégorie ISO

• Environnement

Informations supplémentaires

Maître d'ouvrage :

Direction générale de l’alimentation (DGAL)

Maître d'œuvre :

Ifremer

Financeur(s) :

DGAL/Ifremer

Nom du système de référence

EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 7.9

Niveau topologie

Géométrie seulement

Type de géométries des objets

Complexe

Nombre d'objets géométriques

0

Format (encodage)

Nom	Version

Ressource en ligne

Protocole	Adresse Internet	Nom
WWW:LINK	http://wwz.ifremer.fr/repamo	Site national du REPAMO

Niveau

Jeu de données

Généralités sur la provenance

L'année 2015 est une année de transition initiant l’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins mise en œuvre par l’Ifremer. Le dispositif de surveillance constitué de 4 axes répond à deux objectifs.

Trois axes sont mis en place pour répondre au premier objectif .

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2.

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de la moule bleue Mytilus edulis s’appuyant sur le réseau MYTILOBS 2. Ces deux réseaux se basent sur un suivi régulier d’indicateurs de santé chez les animaux sur des sites ateliers.

La surveillance événementielle des mortalités des autres espèces de mollusques marins (moule Mytilus galloprovincialis comprise) s’appuyant sur le réseau REPAMO 2.Ce réseau, se base sur la déclaration de mortalités des conchyliculteurs ou des pêcheurs professionnels aux services déconcentrés de l’Etat, les Directions Départementales des Territoires et de la Mer (DDTM).Un axe est mis en place pour répondre au deuxième objectif. La surveillance planifiée, ciblée et fondée sur le risque d’introduction et d’installation de Microcytos mackini chez l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2. Cette surveillance se base sur un suivi régulier du site atelier de Loix-en-Ré. La surveillance s'applique à des populations de coquillages d'intérêt commercial que ce soient des populations d'élevage ou des populations sauvages du littoral français.

L'unité épidémiologique peut être une concession ou un parc ostréicole, une écloserie - nurserie, un gisement naturel, une zone ou une partie de zone. Toutes les unités épidémiologiques peuvent faire l'objet d'un échantillonnage en fonction du protocole d’épidémiosurveillance considéré.Les données collectées dans le cadre du réseau REPAMO 2 sont de deux types : des informations concernant le prélèvement (commémoratifs) et des résultats d'analyses. Pour chaque protocole d’épidémiosurveillance, les commémoratifs sont collectés de manière systématique par des correspondants de terrain Ifremer en s’appuyant sur des questionnaires élaborés sous démarche qualité. Les animaux prélevés sont analysés par la cellule analytique du Laboratoire de pathologie et de génétique Ifremer de La Tremblade. La méthode analytique de référence préconisée pour la détection des organismes pathogènes des maladies réglementées est l’histo-pathologie. L'effectif analysé permet de compenser la faible sensibilité et spécificité de cet outil, notamment sur des agents infectieux autres que parasitaires. D'autres outils de diagnostic sont utilisés en complément, principalement des techniques de biologie moléculaire telles que la PCR mais également la culture (bactérienne par étalement – isolement de souches majoritaires, parasitaire en milieu thioglycollate), l'hybridation in situ, la microscopie électronique à transmission, la caractérisation d’espèces par séquençage.

Description

Type de données :

le cadre du réseau ont permis dans certains cas de découvrir de nouveaux agents infectieux directement associés à de la mortalité (Vibrio harveyi sur Haliotis tuberculata par exemple) et de mettre en évidence la présence en France d'agents infectieux considérés jusqu'alors comme exotiques (Perkinsus olseni, Haplosporidium nelsoni, Bonamia exitiosa). Des différences de sensibilité vis-à-vis d'un agent pathogène ont pu être mises en évidence entre populations d'une même espèce.

Nombre de points d'observation ou de mesure :

non prévisible : dépend des déclarations des conchyliculteurs/pécheurs

Précision sur le type de donnée :

Étude des hausses de mortalité : Maintenir un état de veille à l’égard de toute maladie infectieuse affectant les mollusques

Paramètre(s) observé(s) ou mesuré(s) :

Tout organisme pathogène, en particulier ceux réglementés (par l'OIE, l'UE et la France), et les agents infectieux émergents

Résolution du (ou des) paramètre(s) :

30 moribonds et 30 vivants

Fréquence d'actualisation :

continue

Fréquence d'observation :

Variable

Description

Plan d’échantillonnage : non prédéfini

Métadonnées

Identifiant de la fiche

00f4ff71-083c-4652-b29c-5bf3a3bf302c XML

Langue

Français

Jeu de caractères

Utf8

Type de ressource

Jeu de données

Date des métadonnées

2024-06-13T13:35:05.374Z

Nom du standard de métadonnées

ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

Version du standard de métadonnées

1.0

Contact

Nom de l'organisation	Nom de la personne	Adresse e-mail	Rôle
Sextant		sextant@ifremer.fr	Point de contact

Autre langue

LanguageCode	CharacterEncoding
Anglais
Français	Utf8