Date (Creation)

Date (Création)

1992-01-01T00:00:00

Citation identifier

Identificateur

FR-DCSMM-PDS-REPAMO 2

Presentation form

Forme de la présentation

Digital profile

Profil numérique

But

Détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevages, mais aussi détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes exotiques affectant les mollusques marins sauvages et d’élevages.

Reconnaissance

Producteurs de données : conchyliculteurs, DDTM, Ifremer, réseau de laboratoires d'analyses agréés pour la recherche des maladies des mollulsques marins

Status

Etat

On going

Mise à jour continue

Point of contact

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
Ifremer, Laboratoire de Génétique et Pathologie des Mollusques Marins	Lydie Canier	Lydie.Canier@ifremer.fr	Point of contact Point de contact
DGAL, Bureau de la santé animale		bsa.bdspa@agriculture.gouv.fr	Custodian Gestionnaire

Maintenance and update frequency

Fréquence de mise à jour

Unknown

Inconnue

Remarque sur la mise à jour

Durée du réseau : réseau temporaire

Keywords

• Réseau

• Surveillance

• Mollusques

• Pathologie

• Réglementation

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

• Installations de suivi environnemental

  Environmental monitoring facilities

DCSMM : Type d'espace concerné

• Pas d'espace particulier concerné

DCSMM : Descripteurs

• D9: Questions sanitaires

  D9: Health Issues

DCSMM : Méthodes de recueil des données

• Observation par point

Thèmes Sextant

• /Activités humaines/Réseaux d'observation et de surveillance du littoral

  /Human Activities/Coastal monitoring networks

Centre de données ODATIS

• CDS-IS-SISMER

  CDS-IS-SISMER

Type de jeux de donnée ODATIS

• Données d'observation

  Observational data

Thèmatiques ODATIS

• Dispositifs de surveillance

  Monitoring system

Sous-regions marines

• /Métropole

  /Metropolitan France

• /Métropole/Manche mer du Nord

  /Metropolitan France/Channel-North Sea

• /Métropole/Méditerranée occidentale

  /Metropolitan France/Western Mediterranean

• /Métropole/Mers Celtiques

  /Metropolitan France/Celtic Seas

• /Métropole/Golfe de Gascogne

  /Metropolitan France/Bay of Biscay

Thématiques - SIMM

• /Activités et Usages/Pêche et Aquaculture

  /Uses and Human Activities/Fisheries and aquaculture

• Recherche

  Research

• /Etat du Milieu/Pollutions

  /Environmental Status/Pollution

• /Etat du Milieu/Littoral

  /Environmental Status/Coastal areas

ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names

• Invertébrés

  Invertebrates

• Organismes pathogènes

  Pathogenic organisms

Access constraints

Contraintes d'accès

Other restrictions

Autres restrictions

Autres contraintes

Libre

Limitation d'utilisation

Gratuit

Spatial representation type

Type de représentation spatiale

Grid

Raster

Denominator

Dénominateur de l'échelle

6000000

Language

Langue de la ressource

Français

Character set

Encodage des caractères

UTF8

Utf8

Topic category

Catégorie ISO

• Environment
  Environnement

N

S

E

W

Informations supplémentaires

Maître d'ouvrage :

Direction générale de l’alimentation (DGAL)

Maître d'œuvre :

Ifremer

Financeur(s) :

DGAL/Ifremer

Reference system identifier

Nom du système de référence

EPSG /

WGS 84 (EPSG:4326)

/ 7.9

Topology level

Niveau topologie

Geometry only

Géométrie seulement

Geometric object type

Type de géométries des objets

Complex

Complexe

Geometric object count

Nombre d'objets géométriques

0

Distribution format

Name	Version

OnLine resource

Protocol	Linkage	Name
WWW:LINK	http://wwz.ifremer.fr/repamo	Site national du REPAMO

Hierarchy level

Niveau

Dataset

Jeu de données

Généralités sur la provenance

Statement

L'année 2015 est une année de transition initiant l’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins mise en œuvre par l’Ifremer. Le dispositif de surveillance constitué de 4 axes répond à deux objectifs.

Trois axes sont mis en place pour répondre au premier objectif .

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2.

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de la moule bleue Mytilus edulis s’appuyant sur le réseau MYTILOBS 2. Ces deux réseaux se basent sur un suivi régulier d’indicateurs de santé chez les animaux sur des sites ateliers.

La surveillance événementielle des mortalités des autres espèces de mollusques marins (moule Mytilus galloprovincialis comprise) s’appuyant sur le réseau REPAMO 2.Ce réseau, se base sur la déclaration de mortalités des conchyliculteurs ou des pêcheurs professionnels aux services déconcentrés de l’Etat, les Directions Départementales des Territoires et de la Mer (DDTM).Un axe est mis en place pour répondre au deuxième objectif. La surveillance planifiée, ciblée et fondée sur le risque d’introduction et d’installation de Microcytos mackini chez l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2. Cette surveillance se base sur un suivi régulier du site atelier de Loix-en-Ré. La surveillance s'applique à des populations de coquillages d'intérêt commercial que ce soient des populations d'élevage ou des populations sauvages du littoral français.

L'unité épidémiologique peut être une concession ou un parc ostréicole, une écloserie - nurserie, un gisement naturel, une zone ou une partie de zone. Toutes les unités épidémiologiques peuvent faire l'objet d'un échantillonnage en fonction du protocole d’épidémiosurveillance considéré.Les données collectées dans le cadre du réseau REPAMO 2 sont de deux types : des informations concernant le prélèvement (commémoratifs) et des résultats d'analyses. Pour chaque protocole d’épidémiosurveillance, les commémoratifs sont collectés de manière systématique par des correspondants de terrain Ifremer en s’appuyant sur des questionnaires élaborés sous démarche qualité. Les animaux prélevés sont analysés par la cellule analytique du Laboratoire de pathologie et de génétique Ifremer de La Tremblade. La méthode analytique de référence préconisée pour la détection des organismes pathogènes des maladies réglementées est l’histo-pathologie. L'effectif analysé permet de compenser la faible sensibilité et spécificité de cet outil, notamment sur des agents infectieux autres que parasitaires. D'autres outils de diagnostic sont utilisés en complément, principalement des techniques de biologie moléculaire telles que la PCR mais également la culture (bactérienne par étalement – isolement de souches majoritaires, parasitaire en milieu thioglycollate), l'hybridation in situ, la microscopie électronique à transmission, la caractérisation d’espèces par séquençage.

2015 was a year of transition initiating changes in how Ifremer monitors the health of marine molluscs. The monitoring process consists of 4 strands and serves 2 objectives.

Three strands have been put in place to meet the first objective.

Planned monitoring of mortalities and diseases of the Crassostrea gigas oyster using the RESCO 2 network.

Planned monitoring of blue mold Mytilus edulis mortalities and diseases using the MYTILOBS 2 network. These two networks focus on regular monitoring of animal health indicators at the sites.

Events monitoring of mortalities of other species of marine molluscs (the Mytilus galloprovincialis mussel included) using the REPAMO network 2. This network makes use of the data on mortalities reported by shellfish farmers or by professional fishermen to the decentralized services of the State, the Departmental Directorate of Territories and Sea.

One strand has been put in place to meet the second objective. The planned, targeted and risk-based monitoring of the introduction and establishment of Microcytos mackini in the Crassostrea gigas cupped oyster depends on the RESCO 2 network. This monitoring is based on regular follow-up of the Loix-en-Ré site. The surveillance applies to shellfish populations of commercial interest on the French coast whether they are farmed or wild.

The epidemiological unit may be a concession or an oyster farm, a hatchery-nursery, a natural bed, an area or part of an area. All epidemiological units can be sampled according to the given epidemiological surveillance protocol. Two types of data are collected in the REPAMO 2 network: information on the collection (commemorative) and results from analyses. For each epidemiosurveillance protocol, memorials are systematically collected by Ifremer field correspondents based on questionnaires developed as part of a quality approach. The animals collected are analyzed by the analytical section of Ifremer’s Pathology and Genetics Laboratory in La Tremblade. The analytical reference method recommended for the detection of pathogenic organisms of regulated diseases is histopathology. The number of samples analyzed makes it possible to compensate for the low sensitivity and specificity of this tool, especially for infectious agents other than parasites. Other diagnostic tools are used in addition. These include molecular biology techniques such as PCR but also cultures (bacterial spread - isolation of majority strains, parasitic in thioglycolate medium), in situ hybridization, electron microscopy transmission, characterization of species by sequencing.

Description

Type de données :

le cadre du réseau ont permis dans certains cas de découvrir de nouveaux agents infectieux directement associés à de la mortalité (Vibrio harveyi sur Haliotis tuberculata par exemple) et de mettre en évidence la présence en France d'agents infectieux considérés jusqu'alors comme exotiques (Perkinsus olseni, Haplosporidium nelsoni, Bonamia exitiosa). Des différences de sensibilité vis-à-vis d'un agent pathogène ont pu être mises en évidence entre populations d'une même espèce.

Nombre de points d'observation ou de mesure :

non prévisible : dépend des déclarations des conchyliculteurs/pécheurs

Précision sur le type de donnée :

Étude des hausses de mortalité : Maintenir un état de veille à l’égard de toute maladie infectieuse affectant les mollusques

Paramètre(s) observé(s) ou mesuré(s) :

Tout organisme pathogène, en particulier ceux réglementés (par l'OIE, l'UE et la France), et les agents infectieux émergents

Résolution du (ou des) paramètre(s) :

30 moribonds et 30 vivants

Fréquence d'actualisation :

continue

Fréquence d'observation :

Variable

Description

Plan d’échantillonnage : non prédéfini

Metadata

File identifier

Identifiant de la fiche

00f4ff71-083c-4652-b29c-5bf3a3bf302c XML

Metadata language

Langue

Français

Character set

Jeu de caractères

UTF8

Utf8

Hierarchy level

Type de ressource

Dataset

Jeu de données

Date stamp

Date des métadonnées

2024-06-13T13:35:05.374Z

Metadata standard name

ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

Metadata standard version

1.0

Metadata author

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
Sextant		sextant@ifremer.fr	Point of contact Point de contact

Other language

Language	Character encoding
English Anglais
French Français	UTF8 Utf8