Date (Creation)

1992-01-01T00:00:00

Citation identifier

FR-DCSMM-PDS-REPAMO 2

Presentation form

Digital profile

Purpose

Détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevages, mais aussi détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes exotiques affectant les mollusques marins sauvages et d’élevages.

Credit

Producteurs de données : conchyliculteurs, DDTM, Ifremer, réseau de laboratoires d'analyses agréés pour la recherche des maladies des mollulsques marins

Status

On going

Point of contact

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
Ifremer, Laboratoire de Génétique et Pathologie des Mollusques Marins	Lydie Canier	Lydie.Canier@ifremer.fr	Point of contact
DGAL, Bureau de la santé animale		bsa.bdspa@agriculture.gouv.fr	Custodian

Maintenance and update frequency

Unknown

Maintenance note

Durée du réseau : réseau temporaire

Keywords

• Réseau

• Surveillance

• Mollusques

• Pathologie

• Réglementation

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

• Environmental monitoring facilities

DCSMM : Type d'espace concerné

• Pas d'espace particulier concerné

DCSMM : Descripteurs

• D9: Health Issues

DCSMM : Méthodes de recueil des données

• Observation par point

Thèmes Sextant

• /Human Activities/Coastal monitoring networks

Centre de données ODATIS

• CDS-IS-SISMER

Type de jeux de donnée ODATIS

• Observational data

Thèmatiques ODATIS

• Monitoring system

Sous-regions marines

• /Metropolitan France

• /Metropolitan France/Channel-North Sea

• /Metropolitan France/Western Mediterranean

• /Metropolitan France/Celtic Seas

• /Metropolitan France/Bay of Biscay

Thématiques - SIMM

• /Uses and Human Activities/Fisheries and aquaculture

• Research

• /Environmental Status/Pollution

• /Environmental Status/Coastal areas

ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names

• Invertebrates

• Pathogenic organisms

Access constraints

Other restrictions

Other constraints

Libre

Use limitation

Gratuit

Spatial representation type

Grid

Denominator

6000000

Language

Français

Character set

UTF8

Topic category

• Environment

Supplemental Information

Maître d'ouvrage :

Direction générale de l’alimentation (DGAL)

Maître d'œuvre :

Ifremer

Financeur(s) :

DGAL/Ifremer

Reference system identifier

EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 7.9

Topology level

Geometry only

Geometric object type

Complex

Geometric object count

0

Distribution format

Name	Version

OnLine resource

Protocol	Linkage	Name
WWW:LINK	http://wwz.ifremer.fr/repamo	Site national du REPAMO

Hierarchy level

Dataset

Statement

2015 was a year of transition initiating changes in how Ifremer monitors the health of marine molluscs. The monitoring process consists of 4 strands and serves 2 objectives.

Three strands have been put in place to meet the first objective.

Planned monitoring of mortalities and diseases of the Crassostrea gigas oyster using the RESCO 2 network.

Planned monitoring of blue mold Mytilus edulis mortalities and diseases using the MYTILOBS 2 network. These two networks focus on regular monitoring of animal health indicators at the sites.

Events monitoring of mortalities of other species of marine molluscs (the Mytilus galloprovincialis mussel included) using the REPAMO network 2. This network makes use of the data on mortalities reported by shellfish farmers or by professional fishermen to the decentralized services of the State, the Departmental Directorate of Territories and Sea.

One strand has been put in place to meet the second objective. The planned, targeted and risk-based monitoring of the introduction and establishment of Microcytos mackini in the Crassostrea gigas cupped oyster depends on the RESCO 2 network. This monitoring is based on regular follow-up of the Loix-en-Ré site. The surveillance applies to shellfish populations of commercial interest on the French coast whether they are farmed or wild.

The epidemiological unit may be a concession or an oyster farm, a hatchery-nursery, a natural bed, an area or part of an area. All epidemiological units can be sampled according to the given epidemiological surveillance protocol. Two types of data are collected in the REPAMO 2 network: information on the collection (commemorative) and results from analyses. For each epidemiosurveillance protocol, memorials are systematically collected by Ifremer field correspondents based on questionnaires developed as part of a quality approach. The animals collected are analyzed by the analytical section of Ifremer’s Pathology and Genetics Laboratory in La Tremblade. The analytical reference method recommended for the detection of pathogenic organisms of regulated diseases is histopathology. The number of samples analyzed makes it possible to compensate for the low sensitivity and specificity of this tool, especially for infectious agents other than parasites. Other diagnostic tools are used in addition. These include molecular biology techniques such as PCR but also cultures (bacterial spread - isolation of majority strains, parasitic in thioglycolate medium), in situ hybridization, electron microscopy transmission, characterization of species by sequencing.

Description

Type de données :

le cadre du réseau ont permis dans certains cas de découvrir de nouveaux agents infectieux directement associés à de la mortalité (Vibrio harveyi sur Haliotis tuberculata par exemple) et de mettre en évidence la présence en France d'agents infectieux considérés jusqu'alors comme exotiques (Perkinsus olseni, Haplosporidium nelsoni, Bonamia exitiosa). Des différences de sensibilité vis-à-vis d'un agent pathogène ont pu être mises en évidence entre populations d'une même espèce.

Nombre de points d'observation ou de mesure :

non prévisible : dépend des déclarations des conchyliculteurs/pécheurs

Précision sur le type de donnée :

Étude des hausses de mortalité : Maintenir un état de veille à l’égard de toute maladie infectieuse affectant les mollusques

Paramètre(s) observé(s) ou mesuré(s) :

Tout organisme pathogène, en particulier ceux réglementés (par l'OIE, l'UE et la France), et les agents infectieux émergents

Résolution du (ou des) paramètre(s) :

30 moribonds et 30 vivants

Fréquence d'actualisation :

continue

Fréquence d'observation :

Variable

Description

Plan d’échantillonnage : non prédéfini

Metadata

File identifier

00f4ff71-083c-4652-b29c-5bf3a3bf302c XML

Metadata language

Français

Character set

UTF8

Hierarchy level

Dataset

Date stamp

2024-06-13T13:35:05.374Z

Metadata standard name

ISO 19115:2003/19139 - SEXTANT

Metadata standard version

1.0

Metadata author

Organisation name	Individual name	Electronic mail address	Role
Sextant		sextant@ifremer.fr	Point of contact

Other language

Language	Character encoding
English
French	UTF8